Traverse MS

Software de Processamento de Dados que Suporta Dados MRM

O software de processamento de dados Traverse MS foi desenvolvido para o processamento de dados, em alta velocidade, de MRM adquiridos pelos sistemas triplo-quadrupolo da Shimadzu no campo da metabolômica. Utilizando múltiplas amostras e componentes, o software é capaz de criar análises gráficas e estatísticas para interpretação de vias metabólicas.

Obs: O software é um produto da Reifycs Inc.

Características

Múltiplos Cromatogramas em Uma Única Janela

Os cromatgramas para análise de múltiplos componentes de uma única amostra ou de várias amostras podem ser visualizados lado a lado. Esta função permite uma melhor visualização dos dados, tornando o processo de identificação mais fácil. A característica única desta interface para o usuário permite um processo eficiente de identificação de múltiplos componentes.

Algoritmo de Identificação de Picos Especializada para Dados de MRM

O algoritmo de identificação de picos, especializado para dados de MRM, processa informações de múltiplas amostras e componentes em alta velocidade. O algortimo atribui ainda notas para os componentes alvos baseados em sua similaridade para picos de referência especificados. 

Montando Gráficos para o Valor de Área (e Razões de Área) para Múltiplas Amostras

Depois de identificar os picos no dado de MRM, o software cria gráficos para os valores das áreas dos picos para cada componente ou valores das razões de área para os padrões internos. Ao separar as amostras em grupos, o valores da média das áreas e desvios padrões podem ser colocados em gráficos para a comparação entre grupos de amostras. Este tipo de gráfico para dados analíticos permite ao usuário compreender o resultado analítico de forma mais intuitiva.

Análise Estatística Baseado em Análise de Componente Principal (PCA) e Análise de Agrupamento Hierárquico (HCA)

Dados de MRM e múltiplas amostras e componentes podem ser analisados usando técnicas de análise estatística como Análise de Componente Principal (PCA) e Análise de Agrupamento Hierárquico (HCA). Analisar quantidade massivas de dados de MRM de forma individual pode ser extremamente oneroso mas as técnicas de análise estatística fornece ao usuário resultados de fácil compreensão e visualização.

Suporte para Análise de Vias Metabólicas

Para compreender as variações metabólicas em organismos biológicos, é importante compreender as flutuações metabólicas que ocorrem ao longo das vias metabólicas relacionadas aos componentes-alvo. Este software inclui mapas metabólicos básicos para vias de sistemas glicolíticos, pentose fosfato e síntese de aminoácidos, podendo ser carregadas para permitir a visualização de vias metabólicas representativas. Ao unir as flutuações expressas nos gráficos em cada metabólito, a análise da via metabólica pode ser realizada. 

Visualize Múltiplos Cromatogramas de forma Concorrente Usando a FUnção MRM Outlook

A função MRM Outlook pode ser usada para confirmar os picos detectados e executa as correções necessárias ao checar os cromatogramas de todas as amostras comparando com um cromatograma de referência para cada metabólito. Métodos convencionais requerem a checagem manual de cada cromatograma para cada amostra uma a uma, o que não é eficiente. O algoritmo de identificação automática especializado para dados de MRM e a função MRM Outlook no entanto, reduzem significativamente o trabalho envolvido e melhoram a eficiência do processo.

Criando Gráficos a Partir de Uma Matriz de Dados

Matrizes de Dados podem ser categorizadas como "Classes" e normalizar os dados baseados em valores. A altura e a área de cada pico é determinada pelos cromatogramas para cada componente alvo. Baseado nesses valores, o software mostra gráficos de barras da média e desvio padrão dos valores de altura e área para as classes. Estes histogramas permitem ao usuário visualizar os dados de forma simplificada.

Análise de Vias Metabólicas

O software mostra vias metabólicas representativas por permitir que se carregue arquivos template de mapas metabólicos ou por criar um novo arquivo de mapa metabólico.
Gráficos Composto criados a partir de matrizes de dados podem ser unidos para criar vias metabólicas, de forma que os usuários podem compreender a flutuação de metabólitos de interesse em maiores detalhes.

 

Observações e Precauções

  • 1. Para fins de Pesquisa Apenas. Não utilizar para Procedimentos Diagnósticos.
  • 2. A Shimadzu não fornece nenhuma garantia sobre a precisão das informações incluídas na base de dados ou sobre a utilidade das informações obtidas pela utilização desta base de dados.
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