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Cromatógrafo Líquido

Sistema de micro HPLC de 2 dimensões para análise proteômica

 

.: Sistema de micro HPLC de 2 dimensões para análise proteômica

 

 
 

O sistema de micro HPLC 2D de alto desempenho permite realizar a separação de misturas complexas de peptídeos com um alto nível de sensibilidade e resolução. Combinando cromatografia de troca catiônica na primeira dimensão e cromatografia capilar de fase reversa na segunda dimensão e utilizando 6 colunas trap, permite a otimização independente das várias condições de separação. Desta forma, é possível a análise de grande quantidade de traços de peptídeos de digeridos (digests), mostrando ser uma ferramenta extremamente efetiva para a descoberta de proteínas desconhecidas com baixos níveis de expressão. Acoplando o sistema com um espectrômetro de massa de alto desempenho com interface de ionização por electrospray (ESI) é possível obter performance e sensibilidade inigualáveis. Originalmente, o sistema de micro HPLC 2D da Shimadzu foi desenvolvido em colaboração com o laboratório de neurotoxicologia do Instituto de Saúde Mental, Instituto Nacional de Saúde, Estados Unidos.

 Características

1. Permite a análise de proteínas que não podem ser analisadas por eletroforese bidimensional em gel;

. Proteínas altamente iônicas e hidrofóbicas podem ser analisadas on-line pelo sistema micro HPLC 2D.

2. Permite a análise automática com alta resolução e sensibilidade de proteínas com baixos níveis de expressão;

. Digeridos (digests) de proteínas podem ser automaticamente analisados, sendo possível a análise de traços de peptídeos muitas vezes não detectados por eletroforese bidimensional em gel.

3. Análise estável por meio de aprisionamento (trapping) on-line de amostra e dessalinização automática seguida por RPHPLC;

. Uma amostra proveniente da coluna de troca catiônica é aprisionada em 6 colunas mini trap (colunas de fase reversa com poder de retenção equivalente a C4) para dessalinização, seguida de análise por fase reversa. A etapa de dessalinização evita problemas de entupimento na coluna de fase reversa causada pela separação do sal. Desta forma, o método permite análise precisa e estável.

 Procedimento de análise

A Fig. 1 mostra uma visão geral do procedimento de análise para o sistema. Cada etapa do processo é realizada automaticamente, incluindo a injeção de amostras, separação primária, aprisionamento (trapping) do eluato, dessalinização, separação secundária e detecção por LC/MS.

1. Proteínas digeridas enzimaticamente são introduzidas na coluna de troca catiônica

2. Os componentes são eluídos nas 6 colunas trap em ordem de concentração salina

3. Após a dessalinização on-line, os componentes são eluídos nas colunas de fase reversa e a separação é realizada

4. O cromatograma (fase reversa) é obtido para cada fração

Esquema geral do procedimento de análise do sistema de micro HPLC 2D

 Diagrama de fluxo

A Fig. 2 exibe a configuração do sistema de micro HPLC 2D totalmente automatizado. Os peptídeos nas amostras injetadas pelo autosampler são eluídos em ordem da coluna de troca catiônica enquanto a concentração de sulfato de amônio na fase móvel é aumentada gradualmente. Em seguida, o eluato é aprisionado nas colunas trap. Após a dessalinização destas colunas, os peptídeos são então eluídos para a coluna de fase reversa. Depois da separação por fase reversa, a análise é realizada com LC-MS sem qualquer preparação. Uma operação adicional de dessalinização previne a passagem de sais para a interface LC/MS, garantindo análise estável durante longos períodos de operação do sistema.

Diagrama do sistema de micro HPLC 2D

 Exemplo de análise

A Fig. 3 mostra o resultado de análise para uma digestão com tripsina de uma mistura de 6 tipos de proteína (1 pmol cada). Para fins comparativos, o cromatograma superior exibe os resultados de análise obtidos por LC/MS 1D, enquanto que a parte inferior do gráfico exibe os resultados de análise obtidos por LC/MS 2D. O nível de resolução para os peptídeos é melhorado utilizando este sistema.

O sulfato de amônio é utilizado para eluição na etapa primária; as concentrações para cada digerido (digest) são 1mM, 10 mM, 20 mM, 30 mM, 50 mM e 99 mM, respectivamente. Os fluxos utilizados foram ajustados para 80 uL/min (diâmetro interno da coluna: 1mm) e 10 uL/min (diâmetro interno da coluna: 300 um) na primeira e segunda dimensões, respectivamente.

gráfico superior: resultados obtidos por LC/MS 1D

gráfico inferior: resultados obtidos por LC/MS 2D

 
 
         
   

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